马的毛色通常是作为马形体美学的一个外在因素而存在，毛色也可以作为血统注册的一个指标，不过很多人可能会忽略掉毛色对健康也有一定的预测作用。马的毛色花纹是由红，黑和褐色这三种基本颜色混合而成。毛色的表达是受两个基因的控制，分别是延展基因（Extension， E 基因）和Agouti基因（A基因）。E 基因决定了是否黑色会被表达，而A基因决定了黑色素表达的部位。有些马是全身都是黑色的而有些只是在腿，尾巴或是鬃毛的部位有一点黑斑。所有的褐色和黑色的马至少有一条E基因位点。而栗色的操控是属于隐性基因，所以必须有两条e基因位点才行。
马的毛色基因 若想培育一个特定毛色的小马通常的概率跟赌博差不多。科学家可以通过做一些测试来得到粗略的概念，但如果想准确的预测子代的毛色需要一系列复杂的血液检查。这种状况在1997年得到了彻底的改变。从1997年开始，国际上很多科学家开始共同协作，目的是为了在马基因图谱上有所突破。在2007年，马的全组基因图谱被研究出来了。这个全基因图谱给科学家和兽医们提供了非常重要的研究资料。有了这个图谱，我们可以更好的研究一些常见的基因遗传疾病，对于毛色的预测也变得比以前相对容易一些。
基因变异 基因变异是指在细胞分裂过程中基因DNA序列发生永久性的变化。不管公马，母马都能够把这些变异的基因传给自己的子孙。像马这种经过驯养的家畜，饲养者早已经通过不断的选择使得某些特殊的基因变异在群体中固定下来，不再是随机的变化，而是变成每一代子孙都确保含有某个特定的基因变异。
有些时候一些控制毛色的基因的变异则会导致致命的疾病。其中一个例子是含有白斑基因变异的马会引发致死性白斑症。如果马出生的时候携带了一条突变的白斑基因和一条正常白斑基因，那只会表现为身上特别明显的白斑而无其他的发育异常。但如果两条基因都突变了，那马就会表现为全身毛色为白色，伴有各种发育异常，最终会导致死亡。最主要的原因就是这些基因并不仅仅是控制毛色的作用，他们还对细胞分裂，组织增生等胚胎发育过程起重要的作用，因此携带这种突变基因的马会表现为无法消化食物和排泄粪便，出生后几天内就会死亡。因此如果在配种那些有明显白斑的特殊血统的马的时候，需要考虑做一下基因检测，避免生出带有严重缺陷的马。
确定是否含有白斑基因是需要通过基因测序才能确定的。光靠肉眼观察是否有白斑完全不准确。有时马的毛色是完整的深色，看不出任何白斑，却恰恰含有白斑基因，这些跟马的品种都有关。此外对于母马和公马的基因检测往往更为重要，并不是所有的纯白的小马一定就是致死性白斑症，只有携带两条变异白斑基因的才是。其他与毛色相关的疾病 致死性白斑症是唯一与毛色相关的致命的基因突变。但致死性白斑症是唯一与毛色相关的致命的基因突变。但这并不意味着其他毛色控制基因的变异不会造成其他的疾病。一些美国阿帕卢萨马的身上会有豹纹斑点，决定豹纹斑点的基因也会引起先天性的夜盲症。这些马在晚上就看不清楚东西。很多时候马主可能都意识不到这一点，还继续不停的配种来生产白色为主的阿帕卢萨马。除了夜盲症以外，其他一些疾病可能也因此基因的不断的选择而最终被放大。类似的一个问题是银色基因的选择。银色基因会让深色的马有漂亮的银色鬃毛和尾毛，但两条银色基因的变异会导致多种先天性的视觉缺损最终引起失明。
毛色配种的注意事项 通过基因的测序可以帮助我们在选择某些特殊毛色的配种时候更有目的性，同时对马谱系要有一定的了解，因为很有可能远代的一些颜色在配种过程中可能就凸显出来了。还需要注意的是平衡马的健康和美貌之间的关系。扪心自问，你是愿意有一匹颜色漂亮却疾病缠身的马还是愿意毛色平平却健康的马呢？
（马术世界 吕正春）
