纳乔从不令人失望。虽然赛季开始的时候他是理论上的第三中卫，但依靠自己的力量和多面手的特质，他在球队中卫的竞争中赢得了第一的位置。纳乔的上场时间达到了2347分钟，比瓦拉内（2063分钟）多284分钟，比拉莫斯（2021分钟）多326分钟，而后两者是纳乔在中卫位置上的主要竞争者。而巴列霍在皇马的第一个赛季表现不佳，只获得了554分钟的上场时间。
这是纳乔在皇马一队的第5个赛季，因为能在后防线上的4个位置踢球，纳乔成为了球队不可或缺的主力。当然，这也与球队后防线伤病众多有关。瓦拉内已经受伤3次，而对瓦伦西亚的比赛中他又受伤。拉莫斯、巴列霍也都是3次受伤，卡瓦哈尔、特奥和马塞洛都是1次受伤。
在队友们纷纷受伤的时候，纳乔却无比坚强。虽然是糖尿病患者，却没有错失一场比赛。纳乔自己表示：“我有这种运气。或许是因为我的生活方式，我比一般人更注重保养身体。”
纳乔的下一个挑战是让自己在任何情况下，都成为齐达内首发阵容中不可或缺的一员。种种迹象都表明，2月14日对巴黎圣日耳曼的比赛，因为卡瓦哈尔停赛，纳乔将出任球队的右后卫，他将重点盯防内马尔。值得一提的是，本赛季除了防守，纳乔在进攻方面也贡献多多，已经打入了4个进球，进球数等于其他后卫进球数的总和。
皇马本赛季续约了很多球员，包括阿森西奥、伊斯科、马塞洛、本泽马、卡瓦哈尔都获得了续约，但纳乔却不在其中。纳乔上次与皇马续约还是在2013-14赛季，当时他与皇马续约到2021年。纳乔刚刚年满28岁，去年10月份他表示续约的事情正在进行中，不过眼下皇马并未公布与他续约。2016年罗马城试图引进纳乔，但纳乔本人的态度非常明确：“我希望能在皇马退役，我会为这件球衣竭尽全力。”（塞尔吉奥）
